MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 297766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015957	CCCA	2	8	121	128	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_015957	GA	3	6	136	141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015957	GCT	2	6	204	209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
4	NC_015957	GGGC	2	8	228	235	0 %	0 %	75 %	25 %	345007965
5	NC_015957	GCT	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
6	NC_015957	CGT	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
7	NC_015957	GCC	2	6	395	400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
8	NC_015957	CGA	2	6	423	428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
9	NC_015957	CCG	2	6	431	436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
10	NC_015957	GTC	2	6	445	450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
11	NC_015957	CCG	2	6	451	456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
12	NC_015957	AGC	2	6	497	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
13	NC_015957	ACG	2	6	521	526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
14	NC_015957	GCC	2	6	542	547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
15	NC_015957	GCCC	2	8	571	578	0 %	0 %	25 %	75 %	345007965
16	NC_015957	CAG	2	6	595	600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
17	NC_015957	GAC	2	6	637	642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
18	NC_015957	GCA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
19	NC_015957	CGG	2	6	666	671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
20	NC_015957	CAG	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
21	NC_015957	CAG	2	6	739	744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
22	NC_015957	CGGCG	2	10	745	754	0 %	0 %	60 %	40 %	345007965
23	NC_015957	CGGGC	2	10	762	771	0 %	0 %	60 %	40 %	345007965
24	NC_015957	CGGGC	2	10	783	792	0 %	0 %	60 %	40 %	345007965
25	NC_015957	CGG	3	9	798	806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
26	NC_015957	CGG	3	9	810	818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
27	NC_015957	CGGGC	2	10	822	831	0 %	0 %	60 %	40 %	345007965
28	NC_015957	CCG	2	6	841	846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
29	NC_015957	AGC	2	6	851	856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
30	NC_015957	GC	3	6	882	887	0 %	0 %	50 %	50 %	345007965
31	NC_015957	CGG	2	6	891	896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
32	NC_015957	CCT	2	6	903	908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007965
33	NC_015957	CGC	2	6	939	944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
34	NC_015957	GCCCGC	2	12	948	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
35	NC_015957	CG	3	6	981	986	0 %	0 %	50 %	50 %	345007965
36	NC_015957	CGC	2	6	1047	1052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
37	NC_015957	CTG	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
38	NC_015957	CG	3	6	1158	1163	0 %	0 %	50 %	50 %	345007965
39	NC_015957	GGA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007965
40	NC_015957	TCA	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007965
41	NC_015957	CTG	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
42	NC_015957	CGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
43	NC_015957	AGG	2	6	1334	1339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007965
44	NC_015957	TTC	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007965
45	NC_015957	CAA	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007965
46	NC_015957	CTC	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007965
47	NC_015957	AGC	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
48	NC_015957	GGA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007965
49	NC_015957	GCC	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
50	NC_015957	TCC	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007965
51	NC_015957	AAG	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007965
52	NC_015957	AGC	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
53	NC_015957	CGC	2	6	1544	1549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
54	NC_015957	GC	3	6	1607	1612	0 %	0 %	50 %	50 %	345007965
55	NC_015957	CGG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
56	NC_015957	CCG	2	6	1751	1756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
57	NC_015957	ACT	2	6	1757	1762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007965
58	NC_015957	CGA	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
59	NC_015957	TG	3	6	1784	1789	0 %	50 %	50 %	0 %	345007965
60	NC_015957	CG	3	6	1818	1823	0 %	0 %	50 %	50 %	345007965
61	NC_015957	GC	3	6	1880	1885	0 %	0 %	50 %	50 %	345007965
62	NC_015957	CGG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
63	NC_015957	ACG	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
64	NC_015957	GCG	2	6	1953	1958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
65	NC_015957	CCA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015957	GGGA	2	8	2054	2061	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015957	TCG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015957	CGGCC	2	10	2112	2121	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_015957	CCG	2	6	2223	2228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015957	GAT	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015957	AGG	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015957	GAC	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015957	CCG	2	6	2551	2556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015957	A	6	6	2578	2583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015957	CCG	2	6	2584	2589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015957	CTA	3	9	2631	2639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015957	GCC	2	6	2703	2708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015957	CGG	2	6	2752	2757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015957	CGA	3	9	2789	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015957	CAG	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015957	CAG	2	6	2821	2826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015957	GGC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015957	CCG	2	6	2912	2917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007966
84	NC_015957	GGA	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007966
85	NC_015957	GC	3	6	2958	2963	0 %	0 %	50 %	50 %	345007966
86	NC_015957	GAC	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007966
87	NC_015957	CCGG	2	8	3048	3055	0 %	0 %	50 %	50 %	345007966
88	NC_015957	CTC	2	6	3056	3061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007966
89	NC_015957	CGT	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
90	NC_015957	CTC	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007966
91	NC_015957	GGA	2	6	3172	3177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007966
92	NC_015957	CGACCG	2	12	3201	3212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007966
93	NC_015957	CGC	4	12	3235	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007966
94	NC_015957	CGC	2	6	3262	3267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007966
95	NC_015957	GAC	2	6	3275	3280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007966
96	NC_015957	GATCGA	2	12	3307	3318	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007966
97	NC_015957	ACCG	2	8	3344	3351	25 %	0 %	25 %	50 %	345007966
98	NC_015957	CCG	2	6	3405	3410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007966
99	NC_015957	TCGCGC	2	12	3474	3485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345007966
100	NC_015957	ACC	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007966
101	NC_015957	GCT	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
102	NC_015957	TCG	2	6	3636	3641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
103	NC_015957	CGA	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007966
104	NC_015957	CGA	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007966
105	NC_015957	CTG	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
106	NC_015957	CAC	2	6	3865	3870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007966
107	NC_015957	GCT	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
108	NC_015957	GAGC	2	8	3971	3978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015957	CGAAA	2	10	4040	4049	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015957	GGC	2	6	4108	4113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
111	NC_015957	CGC	2	6	4132	4137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007967
112	NC_015957	CAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007967
113	NC_015957	CG	3	6	4226	4231	0 %	0 %	50 %	50 %	345007967
114	NC_015957	CCCA	2	8	4261	4268	25 %	0 %	0 %	75 %	345007967
115	NC_015957	CGA	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007967
116	NC_015957	GCT	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007967
117	NC_015957	GTG	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007967
118	NC_015957	CGG	2	6	4323	4328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
119	NC_015957	AGC	2	6	4364	4369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007967
120	NC_015957	TCG	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007967
121	NC_015957	CGG	2	6	4410	4415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
122	NC_015957	CGG	2	6	4452	4457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
123	NC_015957	CGC	2	6	4458	4463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007967
124	NC_015957	CGAGGG	2	12	4509	4520	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	345007967
125	NC_015957	GAT	2	6	4593	4598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007967
126	NC_015957	GCT	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007967
127	NC_015957	AGG	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007967
128	NC_015957	GCT	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007967
129	NC_015957	GC	3	6	4722	4727	0 %	0 %	50 %	50 %	345007967
130	NC_015957	GGACGA	2	12	4731	4742	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007967
131	NC_015957	GGA	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007967
132	NC_015957	GGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
133	NC_015957	AGG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007967
134	NC_015957	CGC	2	6	4883	4888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007967
135	NC_015957	GAT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007967
136	NC_015957	CGC	2	6	4902	4907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007967
137	NC_015957	CGG	2	6	4923	4928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
138	NC_015957	AGC	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007967
139	NC_015957	ACC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007967
140	NC_015957	AGCA	2	8	4973	4980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015957	TC	3	6	5026	5031	0 %	50 %	0 %	50 %	345007968
142	NC_015957	TCG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007968
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150	NC_015957	AGC	2	6	5487	5492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007968
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241	NC_015957	GAC	2	6	8828	8833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007970
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248	NC_015957	CGA	2	6	9094	9099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007971
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259	NC_015957	GC	3	6	9623	9628	0 %	0 %	50 %	50 %	345007971
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265	NC_015957	GCT	2	6	9763	9768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007971
266	NC_015957	GTC	2	6	9821	9826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007971
267	NC_015957	GAG	2	6	9842	9847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007971
268	NC_015957	GC	3	6	9880	9885	0 %	0 %	50 %	50 %	345007971
269	NC_015957	GAG	2	6	9899	9904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007971
270	NC_015957	TGG	2	6	9924	9929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007971
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275	NC_015957	CAA	2	6	10102	10107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007971
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278	NC_015957	GAG	2	6	10271	10276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007971
279	NC_015957	CGA	2	6	10321	10326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007971
280	NC_015957	CG	4	8	10366	10373	0 %	0 %	50 %	50 %	345007971
281	NC_015957	CTG	2	6	10388	10393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007971
282	NC_015957	CGA	2	6	10399	10404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007971
283	NC_015957	GCG	2	6	10438	10443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007971
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285	NC_015957	CGA	2	6	10504	10509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007971
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298	NC_015957	ACC	2	6	10802	10807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007971
299	NC_015957	CAC	2	6	10808	10813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007971
300	NC_015957	GCT	2	6	10816	10821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007971
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342	NC_015957	CGGT	2	8	12276	12283	0 %	25 %	50 %	25 %	345007972
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355	NC_015957	AAGA	2	8	12802	12809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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364	NC_015957	G	6	6	13077	13082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_015957	CG	3	6	13164	13169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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379	NC_015957	CCG	2	6	13528	13533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007974
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381	NC_015957	CCGGC	2	10	13600	13609	0 %	0 %	40 %	60 %	345007974
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383	NC_015957	GCC	2	6	13775	13780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007974
384	NC_015957	CGCGG	2	10	13798	13807	0 %	0 %	60 %	40 %	345007974
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387	NC_015957	GC	3	6	14007	14012	0 %	0 %	50 %	50 %	345007974
388	NC_015957	CGC	2	6	14036	14041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007974
389	NC_015957	CG	3	6	14127	14132	0 %	0 %	50 %	50 %	345007974
390	NC_015957	GCG	2	6	14143	14148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007974
391	NC_015957	CGC	2	6	14176	14181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007974
392	NC_015957	GTC	2	6	14214	14219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007974
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394	NC_015957	CGG	2	6	14299	14304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007974
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